菲律宾的历史据悉是始于年前的旧石器中晚期，人类使用木筏和原始船只抵达这里，逐渐开始有人类在菲律宾群岛聚居。
殖民前时代（公元年-年）
公元年（中国唐朝时期），汤都王国成立，位于海上丝绸之路最北端，依靠与中国贸易并转手卖与周边群岛带来财富。12世纪来自苏门答腊的米南加保人逐渐移民菲律宾，年建立了苏禄苏丹国，到年（明朝永乐三年），郑和下西洋，到了菲律宾群岛，奉明成祖朱棣诏书封柴佬（福建晋江人）为吕宋总督，统揽军政财文大权，任职直到永乐二十二年（年）。到今天福建晋江人在菲律宾也是最多的。明朝永乐十五年，菲律宾苏禄王到北京朝贡，回程因病死于山东德州，明王朝敕建苏禄王墓。
山东德州苏禄王墓年的西班牙殖民统治
到年，葡萄牙探险家麦哲伦抵达吕宋（为西班牙政府效力），为推行殖民统治，麦哲伦插手宿雾附近小岛之间的首领战争，年4月27日，在登录麦克坦岛时被岛民砍死。
现宿务麦哲伦十字架年，西班牙入侵吕宋，攻占宿务岛。年，攻占吕宋岛，建立马尼拉城。菲律宾这个名字就是从西班牙国王菲利普二世而来。
持续了多年的殖民统治，到年6月，菲律宾国父黎刹（祖籍福建晋江）成立反殖民地联盟，一个月后被捕，同月7日被流放到棉兰佬岛。当天夜里，菲律宾革命之父博尼法西奥成立卡蒂普南革命社团。年8月，滂尼发秀领导的卡蒂普南在马尼拉近郊的马林塔瓦克山发动起义，各地响应，进攻西班牙殖民军。次年阵营内部发生分裂，阿吉纳多篡夺领导权，杀害滂尼发秀，并与西班牙殖民者妥协，但起义者坚持斗争，后面起义者几乎占领全国。
年，因美国与西班牙摩擦不断，又加上美国政府觊觎加勒比海已久，4月24日，西班牙向美国宣战，美国于次日向西班牙宣战。美西战争开始。
美军攻占马尼拉湾战争在古巴、波多黎各和吕宋同时进行。在吕宋，美国海军上将乔治·杜威的舰队在马尼拉湾海战中大获全胜，马尼拉港被封锁，西班牙失去在太平洋的制海权。
8月13日，美军在菲律宾起义军的配合下占领菲律宾马尼拉。同时，从香港出发的美国舰队歼灭了驻守在菲律宾马尼拉港的西班牙舰队。两国于12月10日在法国巴黎签订《巴黎和约》。美国政府给西班牙万美元购买菲律宾主权，美国统治时期开始。
美国殖民统治
阿吉纳多于5月17日乘美舰麦克科洛济(Mcculloch)号返菲。年6月12日菲律宾宣告独立，成立菲律宾共和国。
菲律宾人最初认为他们与美国的关系是两个国家共同与西班牙战斗。然后之后，美国与菲律宾起义者保持了距离。美国并没有履行支持菲律宾独立，双方关系恶化，紧张局势升级。年2月4日马尼拉市郊圣胡安，两名美国士兵杀害三名菲律宾士兵之后，双方发生对抗，导致了美菲战争爆发，最终以失败告终，菲律宾沦为美国的殖民地。
美菲战争二战时期被日本占领
年日本入侵菲律宾开始，日军和盟军在此期间曾多次激战。在大战尾声时，发生了马尼拉大屠杀，估计共有十万名菲律宾平民死亡。
日军攻占菲律宾菲律宾独立
年4月，菲律宾举行了大选。曼努埃尔·罗哈斯成为第一任菲律宾总统。年7月4日，美国将菲律宾主权转交与菲律宾，菲律宾获得完全独立。
